La escasez del agua potable es notoria, debido entre otros aspectos a que su disponibilidad espacial es compleja, lo que ha provocado la sobreexplotación de los acuíferos de la región, así como de la necesidad de importar grandes volúmenes de agua de otras cuencas. Aunado a estos problemas se ha detectado un gran dispendio del recurso, no se realizan verdaderos esfuerzos por eficientar su uso y el avance en la administración de los usos del agua es sumamente bajo.

La contaminación del recurso se encuentra en un nivel elevado, tanto en las fuentes superficiales como ríos y arroyos, así como en las presas y lagos de la región, como en la mayor parte de los acuíferos, debido a los grandes volúmenes de aguas residuales generados principalmente en la ZMCM que se vierten al Río Tula sin previo tratamiento, lo que ha generado graves problemas ambientales tanto en el medio urbano como en el rural. Esta inadecuada calidad de los efluentes de la región limitan el reuso y el intercambio del agua.